Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTXN1P60606 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms