Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVFC1P60507 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms