Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RP1P56715 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms