Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP1P56715 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP1P56715 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP1P56715 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP1P56715 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP1P56715 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP1P56715 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP1P56715 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RP1P56715 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP1P56715 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP1P56715 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RP1P56715 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP1P56715 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP1P56715 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP1P56715 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RP1P56715 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP1P56715 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms