Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S2P56377 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms