Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA1P56199 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms