Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRISP3P54108 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms