Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOSBP53539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOSBP53539 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOSBP53539 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOSBP53539 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOSBP53539 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOSBP53539 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOSBP53539 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSBP53539 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSBP53539 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSBP53539 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSBP53539 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSBP53539 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSBP53539 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSBP53539 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms