Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND2P52198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND2P52198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND2P52198 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND2P52198 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND2P52198 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND2P52198 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND2P52198 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND2P52198 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND2P52198 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND2P52198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND2P52198 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RND2P52198 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RND2P52198 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RND2P52198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RND2P52198 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RND2P52198 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RND2P52198 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms