Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLK3P49761 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLK3P49761 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK3P49761 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK3P49761 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK3P49761 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK3P49761 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK3P49761 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK3P49761 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK3P49761 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK3P49761 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK3P49761 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK3P49761 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK3P49761 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms