Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM4P49221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM4P49221 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM4P49221 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM4P49221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM4P49221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM4P49221 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM4P49221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM4P49221 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM4P49221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM4P49221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGM4P49221 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGM4P49221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM4P49221 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM4P49221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM4P49221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM4P49221 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms