Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT6CP48668 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms