Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME1P48163 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME1P48163 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME1P48163 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME1P48163 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME1P48163 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME1P48163 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME1P48163 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME1P48163 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ME1P48163 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME1P48163 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME1P48163 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME1P48163 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME1P48163 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME1P48163 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME1P48163 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME1P48163 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME1P48163 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME1P48163 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME1P48163 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME1P48163 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME1P48163 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME1P48163 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME1P48163 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME1P48163 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ME1P48163 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME1P48163 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME1P48163 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME1P48163 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME1P48163 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME1P48163 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME1P48163 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME1P48163 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME1P48163 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME1P48163 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms