Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYKP43405 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYKP43405 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYKP43405 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYKP43405 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYKP43405 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYKP43405 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYKP43405 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYKP43405 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYKP43405 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYKP43405 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYKP43405 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYKP43405 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYKP43405 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYKP43405 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYKP43405 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms