Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A1P43005 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms