Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX19P40855 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX19P40855 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX19P40855 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX19P40855 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX19P40855 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX19P40855 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX19P40855 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX19P40855 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX19P40855 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX19P40855 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX19P40855 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX19P40855 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms