Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6BP35913 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6BP35913 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms