Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFC1P35251 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RFC1P35251 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC1P35251 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC1P35251 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC1P35251 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC1P35251 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC1P35251 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC1P35251 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC1P35251 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC1P35251 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC1P35251 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC1P35251 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC1P35251 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC1P35251 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC1P35251 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC1P35251 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC1P35251 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms