Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGS1P23219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGS1P23219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGS1P23219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms