Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB6AP20340 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB6AP20340 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms