Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGCP20142 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGCP20142 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGCP20142 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGCP20142 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGCP20142 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGCP20142 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGCP20142 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGCP20142 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGCP20142 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGCP20142 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGCP20142 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGCP20142 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGCP20142 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGCP20142 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGCP20142 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGCP20142 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PGCP20142 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms