Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKMT2P17540 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms