Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT5P13647 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT5P13647 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT5P13647 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT5P13647 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT5P13647 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT5P13647 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT5P13647 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT5P13647 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT5P13647 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT5P13647 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT5P13647 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT5P13647 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT5P13647 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT5P13647 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT5P13647 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms