Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MS4A1P11836 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MS4A1P11836 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MS4A1P11836 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MS4A1P11836 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MS4A1P11836 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MS4A1P11836 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MS4A1P11836 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms