Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD48P09326 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD48P09326 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD48P09326 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD48P09326 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD48P09326 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD48P09326 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD48P09326 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD48P09326 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD48P09326 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD48P09326 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD48P09326 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD48P09326 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD48P09326 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD48P09326 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD48P09326 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD48P09326 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD48P09326 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms