Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN1P07384 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN1P07384 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms