Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPIND1P05546 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPIND1P05546 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms