Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGF1P05230 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FGF1P05230 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGF1P05230 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGF1P05230 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGF1P05230 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGF1P05230 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGF1P05230 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGF1P05230 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGF1P05230 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGF1P05230 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGF1P05230 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGF1P05230 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGF1P05230 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGF1P05230 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGF1P05230 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGF1P05230 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGF1P05230 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGF1P05230 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FGF1P05230 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGF1P05230 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms