Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRUB2O95900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms