Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24DO94855 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms