Protein–RNA interactions for Protein: O75695

RP2, Protein XRP2, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP2O75695 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RP2O75695 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RP2O75695 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RP2O75695 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RP2O75695 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RP2O75695 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RP2O75695 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RP2O75695 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RP2O75695 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RP2O75695 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RP2O75695 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RP2O75695 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RP2O75695 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RP2O75695 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RP2O75695 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RP2O75695 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RP2O75695 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RP2O75695 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
RP2O75695 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RP2O75695 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms