Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ULK1O75385 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK1O75385 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK1O75385 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK1O75385 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK1O75385 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK1O75385 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK1O75385 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK1O75385 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK1O75385 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK1O75385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK1O75385 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK1O75385 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK1O75385 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK1O75385 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK1O75385 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ULK1O75385 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ULK1O75385 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK1O75385 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK1O75385 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK1O75385 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK1O75385 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK1O75385 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK1O75385 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms