Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP2O75323 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP2O75323 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP2O75323 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms