Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
DENND4BO75064 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DENND4BO75064 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DENND4BO75064 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DENND4BO75064 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DENND4BO75064 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms