Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM20BO75063 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM20BO75063 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM20BO75063 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20BO75063 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM20BO75063 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20BO75063 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20BO75063 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms