Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms