Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUV39H1O43463 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms