Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms