Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3FO00303 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms