Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGRMC1O00264 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRMC1O00264 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms