Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN8O00124 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms