Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 530.8 ms