Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TARM1B6A8C7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TARM1B6A8C7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms