Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNL1A8MU46 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMTNL1A8MU46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMTNL1A8MU46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms