Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA3AA6NCI4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3AA6NCI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms