Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL33A6NCF5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms