Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC13A5PLN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms