Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC162PA2VCL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms