Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms