Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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