Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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